Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10488Q4KL05 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10488Q4KL05 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms