Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL04

Gm5168, Predicted gene 5168, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5168Q4KL04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5168Q4KL04 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm5168Q4KL04 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm5168Q4KL04 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5168Q4KL04 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms