Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tigd5Q499M4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tigd5Q499M4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms