Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pacs2Q3V3Q7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms