Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc110Q3V125 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms