Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ccdc185Q3V118 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ccdc185Q3V118 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ccdc185Q3V118 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ccdc185Q3V118 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ccdc185Q3V118 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc185Q3V118 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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