Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Lrrc43Q3V0L5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrc43Q3V0L5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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