Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccdc160Q3UYG1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms