Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn4Q3UWL8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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