Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Slfn4Q3UV66 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Slfn4Q3UV66 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms