Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm29609Q3UU56 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm29609Q3UU56 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm29609Q3UU56 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm29609Q3UU56 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms