Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm28047Q3US59 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28047Q3US59 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms