Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Acsf3Q3URE1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Acsf3Q3URE1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms