Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms