Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp30Q3UN04 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Usp30Q3UN04 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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