Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cog7Q3UM29 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms