Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp3Q3ULW8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms