Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Edc4Q3UJB9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edc4Q3UJB9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms