Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms