Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pid1Q3UBG2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms