Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms