Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ssbp4Q3U4B1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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