Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf40Q3U319 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf40Q3U319 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf40Q3U319 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf40Q3U319 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf40Q3U319 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf40Q3U319 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf40Q3U319 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf40Q3U319 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf40Q3U319 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rnf40Q3U319 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rnf40Q3U319 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf40Q3U319 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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