Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud5Q3U2S4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms