Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LcorlQ3U285 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LcorlQ3U285 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms