Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serac1Q3U213 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms