Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fbxw18Q3TSA9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fbxw18Q3TSA9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Fbxw18Q3TSA9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxw18Q3TSA9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxw18Q3TSA9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fbxw18Q3TSA9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fbxw18Q3TSA9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms