Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

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Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem104Q3TB48 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem104Q3TB48 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms