Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Colec11Q3SXB8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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