Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prex2Q3LAC4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prex2Q3LAC4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms