Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam178bQ24JP3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam178bQ24JP3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms