Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shroom4Q1W617 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms