Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne9Q1RLL3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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