Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam47cQ14BE7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam47cQ14BE7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms