Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc162pQ0VG85 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms