Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp2b3Q0VF55 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms