Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab42Q0PD08 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms