Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vps8Q0P5W1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps8Q0P5W1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms