Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata18Q0P557 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms