Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cass4Q08EC4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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