Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
MitfQ08874 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms