Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a2Q07643 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a2Q07643 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms