Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nfe2Q07279 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nfe2Q07279 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms