Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gdf3Q07104 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gdf3Q07104 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms