Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Siah1bQ06985 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms