Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr16c6Q05A13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms