Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtprgQ05909 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms