Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fmn1Q05860 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fmn1Q05860 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms