Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Emx2Q04744 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms