Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcad1Q04692 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms